山桐子是我国本土特有木本油料树种，果实含油量高，富含亚油酸等不饱和脂肪酸，具有“树上油库”的美誉。山桐子树可莳植于非耕地、边际土地以及林地等，培育高品质山桐子种质资源，对包管国家粮食清静具有主要意义。
中国科学院植物研究所王雷研究组通过剖析山桐子染色体级别基因组，团结山桐子多组织和器官的转录组数据，系统叙述了山桐子的基因组特征。发明其基因组巨细约为1.21 Gb，由21条染色体组成，包括42086个卵白编码基因；诤嘶蜃橄低辰髌饰，发明山桐子与杨树亲缘关系细密，应归属为杨柳科，而不是古板上以为的大风子科。
基因组进化剖析发明山桐子与杨树约莫在1628万年前爆发分解。但与杨树相比，山桐子基因组脂肪酸合成酶基因具有显著扩张；且脂肪酸合成基因如催化亚油酸合成的脂肪酸去饱和酶FAD2在果实中高度表达，这也在一定水平上诠释了山桐子果实高含油量以及亚油酸含量较高的缘故原由。进一步对来自北京、四川、陕西和西藏等地的42份山桐子种质的果实含油率举行全基因组关联剖析，并团结转录组数据，判断到一个可能影响果实含油率、其编码为蔗糖转运卵白的要害基因IpSTP5。
基于山桐子果实病毒诱导基因默然（Virus-Induced gene silencing, VIGS）手艺系统，发明IpSTP5基因默然可导致果实含油率和亚油酸含量显著下降。同时，还判断到一个影响山桐子果实巨细的基因IpTGW6，并发明该基因在果实中的默然可导致果实膨大受阻。这些要害基因的掘客为山桐子优良品种选育提供了理论依据，相关基因及其分子标记的应用已经申请了多项国家专利。
该研究效果于3月6日在线揭晓于国际学术期刊Cell Reports。植物所助理研究员左毅、中国农业科学院深圳基因组所博士后刘红兵、植物所工程师李彬为论文配合第一作者，王雷研究员为通讯作者。中国科学院北京基因组研究所汪敏先研究员、中国科学院遗传与发育生物学研究所梁承志研究员等也加入了部分研究事情。该研究获得了国家盐碱地综合使用手艺立异中心院士事情站项目和中国科学院墟落振兴项目等的资助。
山桐子基因组特征、系统进化、含油率全基因组关联剖析以及候选基因的判断
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https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2211124724002377